В настоящее время в Узбекистане осуществляют деятельность 2 тысячи 276 религиозных организаций, в том числе 183 неисламских религиозных организаций, из которых 8 еврейских общин, 6 общин бахай и по одному «Свидетели Иеговы», общество кришнаитов, буддийский храм, а также межконфессиональное Библейское общество и другие, которые представляют 16 различных конфессий.
Также действуют Международный научно-исследовательский центр Имама Бухари, Центр Исламской цивилизации, Центр Христиан полного Евангелия Узбекистана, Союз церквей Евангельских христиан – баптистов Узбекистана и другие.
За последние годы в республике органами юстиции зарегистрированы такие религиозные организации, как Пятидесятническая церковь «Свет миру», Церковь Евангель-христиан «Сун Богым» в Ташкентской области и Церковь Евангель-христиан баптистов в Хорезмской области, а также Кокандская церковь Евангельских христиан (Пятидесятников) «Возрождение».
Во втором полугодии 2019 года зарегистрированы Ташкентская церковь Христиан полного Евангелия «Логос», Церковь «Возрождение» — (город Навои, Навоийская область.), Церковь «Вера» — (город Самарканд, Самаркандская область), Церковь евангельских Христиан баптистов (город Гулистан) и Церковь евангельских Христиан «Дом хлеба» (город Джизак).
Данная информация была представлена в ходе «круглого стола» на тему «Гарантия свободы вероисповедания – важная основа открытого гражданского общества», состоявшегося в Институте стратегических и межрегиональных исследований при Президенте Республики Узбекистан. В дискуссии приняли участие представители профильных министерств и ведомств, общественных организаций и религиозных конфессий, эксперты в сфере религии, а также представители дипломатического корпуса, аккредитованного в Ташкенте.
На мероприятии подчеркивалось, что в Узбекистане уделяется огромное внимание не только сохранению исламских ценностей и распространению учения исламской религии, но также укреплению межконфессионального диалога. Также отмечалось, что в соответствии с Постановлением Президента Узбекистана, принятым в апреле 2018 года, руководители всех 16 религиозных конфессий включены в состав Совета по делам конфессий. Данный Совет является общественно-консультативным органом Комитета по делам религий при правительстве республики.